发酵罐是由3条线路构成的，一个是空气的进出（不进入夹层），蒸汽的进出（只在对空气过滤器灭菌时才进入罐体，发酵罐是从夹层的上进下出的），水的进出（进入夹层内，从下进上出。当开始发酵时，水路会形成一个循环，由温度感应器对其进行调节，保证水的温度在发酵所需温度范围内）。
发酵罐对发酵培养室进行消毒处理，消毒处理方法如下：
1、使用是100级以上空气净化设备对液体菌种培养发酵室进行空气净化处理30分钟。上述方法可以任选其一，如果能交差使用效果更好。
2、用臭氧机加紫外线灯照射30分钟对液体菌种培养发酵室空间消毒处理。
3、用二氯异氰尿酸纳或高锰酸钾加甲醛溶液常规消毒药物进行30分钟密闭薰蒸处理。
发酵罐接种流程
1、将接种口封盖向上放到一边，右手拿菌种三角瓶，将瓶口部倾斜至酒精火焰圈上部，倾斜角度以菌种瓶内液体不沾到棉塞为宜。然后旋转三角瓶，对瓶口部位灼烧消毒处理，30秒时间左右旋转5圈以后用左手将三角瓶棉塞旋转着缓缓取下，再将三角瓶内菌液倒入液体菌种发酵罐内。
2、将棉花搓成长33厘米直径1厘米粗的棉绳，用95%酒精浸泡湿透，再将棉绳缠绕至接种口周围，要求缠紧，系劳，不要缠在接种口封盖上。缠好棉绳以后点燃棉绳，使接种口周围形成一个酒精火焰保护圈。
3、接种人员以缓冲间更换工作服，戴好防尘帽，口罩进入已经做好消毒处理的液体菌种发酵培养室，先用75%的酒精喷壶对空间进行喷雾降尘消毒处理。
4、带好双层棉线手套，放到凉水内沾湿手套，然后将发酵罐排气阀开大，当罐内压力降到到接近0时迅速用撬棍或钳子将接种口封盖打开，另一只手关闭发酵罐排气阀，使罐内压力从接种口排出，使罐内形成正压，以避免接种环节带入杂菌。
